Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

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Length 589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AU022751B1B0V2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AU022751B1B0V2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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