Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms