Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3aB1AWZ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms