Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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