Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grik3B1AS29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms