Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm6880A3KG45 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6880A3KG45 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms