Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf2A2AT37 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf2A2AT37 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms