Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pramef25A2ASI9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef25A2ASI9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms