Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ambra1A2AH22 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms