Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhbdl2A2AGA4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms