Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms