Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp8nlA2ABX0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms