Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb4A2A863 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb4A2A863 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms