Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smurf2A2A5Z6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smurf2A2A5Z6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms