Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trav12-2A0N8N6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trav12-2A0N8N6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trav12-2A0N8N6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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