Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700028J19RikA0A0U1RP08 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms