Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Trbv30A0A0B4J1P1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv30A0A0B4J1P1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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