Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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