Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trbv1A0A0B4J1G7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv1A0A0B4J1G7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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