Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE2

Trbv3, T cell receptor beta, variable 3 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv3A0A0A6YYE2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv3A0A0A6YYE2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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