Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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