Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CDKN3Q16667 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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