Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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