Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NDUFA9Q16795 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms