Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
POLD1P28340 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
POLD1P28340 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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