Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Gm23240-201ENSMUST00000083009 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxd11P23813 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Snord58b-201ENSMUST00000082937 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Gm37646-201ENSMUST00000191756 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Hoxd11P23813 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm25158-201ENSMUST00000177681 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm26229-201ENSMUST00000179699 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd11P23813 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd11P23813 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd11P23813 Gm25431-201ENSMUST00000101978 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Mir1948-201ENSMUST00000157325 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Hoxd11P23813 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Mir466q-201ENSMUST00000175249 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd11P23813 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd11P23813 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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