Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms