Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Serpinb6cW4VSP4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpinb6cW4VSP4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms