Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc166S4R181 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc166S4R181 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms