Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcniQ9Z2V9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcniQ9Z2V9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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