Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdac5Q9Z2V6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdac5Q9Z2V6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms