Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdac6Q9Z2V5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Hdac6Q9Z2V5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Hdac6Q9Z2V5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdac6Q9Z2V5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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