Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Knop1Q9Z2Q2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms