Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp5Q9Z2P8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms