Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubl3Q9Z2M6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms