Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gipc2Q9Z2H7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gipc2Q9Z2H7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms