Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn6Q9Z262 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cldn6Q9Z262 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn6Q9Z262 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Cldn6Q9Z262 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cldn6Q9Z262 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn6Q9Z262 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms