Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn7Q9Z261 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Cldn7Q9Z261 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn7Q9Z261 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Cldn7Q9Z261 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cldn7Q9Z261 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn7Q9Z261 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms