Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn8Q9Z260 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn8Q9Z260 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms