Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf394Q9Z1D9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf394Q9Z1D9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms