Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sumo3Q9Z172 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sumo3Q9Z172 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sumo3Q9Z172 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sumo3Q9Z172 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sumo3Q9Z172 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sumo3Q9Z172 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sumo3Q9Z172 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sumo3Q9Z172 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sumo3Q9Z172 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sumo3Q9Z172 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms