Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AireQ9Z0E3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AireQ9Z0E3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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