Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Carm1Q9WVG6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Carm1Q9WVG6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms