Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Scnn1gQ9WU39 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scnn1gQ9WU39 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scnn1gQ9WU39 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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