Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pfdn5Q9WU28 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn5Q9WU28 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pfdn5Q9WU28 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn5Q9WU28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn5Q9WU28 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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