Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdh13Q9WTR5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms