Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trpc2Q9R244 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trpc2Q9R244 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms