Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sorbs3Q9R1Z8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sorbs3Q9R1Z8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms