Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lhx6Q9R1R0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lhx6Q9R1R0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms