Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clec4eQ9R0Q8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clec4eQ9R0Q8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms